对于各个衙门的请款，朱载坖也分门别类的予以了处理，首先自然就是兵部、军器监和工部这三个大头，朱载坖要求军器监就是更新设备，扩建厂房等事情先予以详细计划，同时对于官军的换装计划予以详细规划，军器监的生产要有计划，同时就是扩大这些武器装备的出口等问题，朱载坖很清楚，武器装备的出口是很有利润的事情，对于大明来说，也要成为重要的军器出口国家，才能够从中获利。
所以对于军器监相关工场的扩建，朱载坖予以了大力支持，要求必须留有余地，能够大规模的快速扩充生产，同时对于官军所更换下来的老旧火器，也不是扔炉子里面炼钢，除了将其中状态比较好的予以修整之后转交给巡检官军使用之外，还有就是将之修理好准备出售。
朱载坖命令礼部以及理藩总署，和大明在南洋的这些藩属商量，准备将这些淘汰的火器卖给他们，第一就是加强这些藩属自身的力量，他们是要承担起大明的藩篱这个重要的任务的，所以必须有一定的军事实力，其次就是西洋，现在西洋战乱频仍，各种武器的销售肯定是极为抢手的，这些大明所淘汰的火器质量并不差，朱载坖准备把他们都卖给尼德兰人或者是其他需要的国家，西洋打的约厉害，对于大明来说就越好。
除此之外就是对于水师所申请的追加造舰费用，朱载坖特旨予以批准，要求朝廷立即拨给，水师造舰是迟疑不得的事情，必须保证大明水师的战略优势，同时对于现有战舰的火炮，也要优先予以更易，保证官军水师的优势。
要求追加投资最多的就是工部的，尽管内阁和户部要求工部和交通总署降低请款总数，裁减一些不必要的项目，但是即便是经过精简之后，交通总署所请款的总数仍旧高达五千万元，这个数字也是极为庞大的，即便是分摊到十年，每年的支出也高达五百万元，但是对于这个大规模的营建基础设施的计划，朱载坖仍旧予以了批准。
因为按照交通总署的这个机关，朝廷的直道将会修通到兰州，然后跨越黄河，沿兰州直抵哈密，向南从广州延伸到安南府，同时对于云贵川三省和缅甸的陆路交通，也要予以改善，虽然以现在大明的技术能力，确实无法做到大规模的改善四川和内地的交通，但是交通总署仍旧规划了川陕直道。
以前的川陕道路，都是十分之险峻的，如子午道从西安府开始向正南，沿子午谷入山后不久，即转入淬水河谷，溯谷而上，翻越秦岭，稍折西南，经洵河上游，南过腰竹岭，顺池河到汉江北岸的池河镇附近，又陡转西北，大致沿汉江北岸，经石泉县，绕黄金峡西到洋县，再西到汉中。
而现在由陕入川，最为便捷的就是连云道，连云道从陕西宝鸡向南，到达凤县凤州镇后折向东南，越柴关岭进入汉中留坝县，再经勉县到达汉中。全长近五百里。
云道颇为取巧，北段借用故道（陈仓道）的一部分，南段则沿用褒斜道的路段。这样它既排除了褒斜道的途程险峡，又避免了故道的回曲绕折，既利用了故道的缓冲开阔，又利用了褒斜道的捷足先登。因而，自北魏新开凿此道以后，连云道上一直是畅通无阻。
直至现在，连云道一直是川陕官道。现在的过往行旅、客商、成群结队的骆驼队、上百的马帮，来来往往，一片热闹景象。但是这条道路仍旧不够便捷，所以交通总署决定修建川陕直道，联系四川和陕西两省，加强朝廷对于四川的控制，这点是极为重要的。
但是川陕直道所需要钱粮数目是十分之庞大，现在西安府经凤翔至宝鸡已修成土路，勉强通车，宝鸡至汉中要跨越秦岭山脉，山道崎岖，尚未修建，仍需由骡马滑竿通行，费时需半月之久，现在朝廷在陕西方向要修通翻越秦岭的直道，其中最险峻的就是自观音堂至秦岭顶，直线距离不过八里，而高差达一里半，交通总署反复踏勘比较，充分利用地形，提早升坡，合理布线，选定了三十里的翻山路线。
除此之外，在川陕直道陕西段，新建水磨河、黄沙河等石拱桥11座、石台木面桥6座、涵洞69道，而在四川段，线路自陕西汉中起，经镇巴、万源、达州等地至成都府，穿越大巴山脉，难度同样也不小，所以交通总署预计十年才能够修通，但是此举对于朝廷加强对于四川等地的控制，从四川方向经略乌斯藏，作用是十分巨大的，所以朱载坖支持了交通总署的计划。
这次朝廷的直道修筑，主要是针对交通不够便利还有就是新收复的地方，加强朝廷对于这些地方的控制，同时通过大规模的道路营建等拉动大明的经济发展，这点也是极为重要的。
而对于司农寺要求提高朝廷仓储的事情，朱载坖也是支持的，但是对于提高仓储一事，朱载坖认为不能操之过急，首先就是加强朝廷的粮食收储，提高司农寺收购粮食的价格，激发百姓种植粮食的积极性，然后就是积极谋划南粮北运的事情，尽管朝廷在河套等地大规模的开垦粮食，但是北方缺乏粮食仍旧是朱载坖很担心的事情。
所以朱载坖一再强调的就是南粮北运，而在从天津到京通仓的马拉铁路修通之后，朱载坖要求礼部和理藩总署和暹罗、占城两国重新谈判，增加大明从这两国和买的粮食数量，同时就是加强缅甸的道路交通，除了水运之外，还有就是从镇南府到仰光府的直道，这条直道主要是便于将缅甸腹地所出产的粮食和铜料等运抵仰光府，然后海运转解到京师来，以增加朝廷在北方的粮食储备。